Первая Красноборская лечебница на 15 коек была открыта в октябре 1897 года. Главным врачом лечебницы назначили земского врача Александра Евгеньевича Богоявленского, с ним работали 2 фельдшера. В 1904 году строится новое здание заразного барака, в 1906 году - здание для терапевтического отделения, в 1910 - амбулатория и квартира для врача.
К концу 1926 года в районе работает три больницы: Красноборская, Березонаволоцкая, Пермогорская - с количеством коек до 30; 5 санитарно-фельдшерских пунктов, консультация для детей и беременных женщин.
В 1944 году открыт туберкулезный пункт на 15 коек. Во время Великой Отечественной войны действовало: 5 больниц с общим числом коек - 102; 2 родильных дома с числом коек - 4; 14 ФАПов.
В послевоенные годы ежегодно расширяется сеть лечебно-профилактических учреждений, оказывающих бесплатную медицинскую помощь населению.
В 1957 году в районе имелось уже 6 больниц и 25 фельдшерских пункта, в них работало 26 врачей и 126 средних медицинских работника.
После реорганизации Черевковского района к Красноборскому району присоединили Черевковский сельский совет и Черевковскую районную больницу № 2, ясли и 4 медпункта.
В 1977 году в районе работало 5 больниц на 220 коек и 23 фельдшерско-акушерского пункта.
В 1983 году построена поликлиника Красноборской ЦРБ на 200 посещений в смену, новая прачечная, овощехранилище, гаражи.
В 1997 году закрыто 2 ФАПа в связи с малой численностью жителей и финансово-экономическими трудностями.
В период с 1997 по 2015 годы произошло сокращение круглосуточных коек в стационарах ЦРБ со 165 до 74.
В 2001 году открыт дневной стационар при поликлинике на 8 коек. В 2015 году функционирует 29 коек дневного стационара.